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ESMO 2020 ca88基因早筛新希望之胰腺癌：cfDNA甲基化靶向测序 ，破解胰腺导管腺癌致命难题
2020-09-21
泉源：ca88生物
一直以来 ，胰腺癌被称为“万癌之王” ，以高殒命率著称。胰腺导管腺癌（PDAC）是胰腺癌最常见的亚型 ，是最致命的恶性肿瘤之一 ，其预后差 ，治疗手段有限。早期诊断成为了胰腺导管腺癌患者提高5年生涯率的要害。怎样实现胰腺导管腺癌的早期诊断 ，成为了ca88基因与相助同伴迫切想要解决的问题。
在2020 ESMO年会上 ，ca88基因与北京协和医院、上海长海医院相助宣布了“Early detection of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) using methylation signatures in circulating tumor DNA【ctDNA甲基化特征在胰腺导管腺癌（PDAC）早期检测中的应用】”主题壁报。
该研究基于NGS手艺 ，开发了一个含有PDAC特异性DNA甲基化标记物的靶向测序Panel ，并证实晰这一Panel能通过检测血浆样本准确识别PDAC。
该研究使用ca88基因拥有自主专利的MONOD剖析手艺 ，从PDAC组织样本和癌旁组织样本中识别出了具有PDAC特异性的DNA甲基化标记物 ，形成了PDAC V1 Panel。在去年的ESMO年会上 ，ca88基因已宣布了既往已揭晓标记物相关的基因在该研究标记相关的基因中高度富集 ，批注它们可能配合调理与PDAC病理相关的统一组基因。
今年 ，研究团队从去年揭晓的PDAC V1 Panel中选择了性能最好的标记物 ，构建了PDAC V2 panel ，并增添每个目的的测序深度 ，大大提高了信噪比和样本之间的一致性。优化后的检测要领能通过血浆样本有用区分PDAC患者、正常比照人群和慢性胰腺炎（CP）患者 ，如图1所示 ，在测试集中判别PDAC与正常比照人群 ，该检测要领的平均AUC为0.911（95%CI：0.838～0.971）；在测试集中判别PDAC与CP ，其平均AUC为0.847（95%CI：0.737～0.941）。
图1 cfDNA甲基化标记物区分PDAC、正常比照人群和CP的准确性
从图2 可知 ，用该检测要领和机械学习算法 ，在训练集和测试集中正常比照血浆、CP血浆和各期均可以获得相对应的、相对稳固的检测分数。由此可见 ，使用cfDNA甲基化标记物检测 ，可以高度准确地区分PDAC、正常比照人群和CP ，并且cfDNA甲基化标记物用于PDAC早期检测具有可行性。
图2 cfDNA甲基化标记物区分正常比照人群、CP和 差别阶段PDAC的准确性
该研究进一步较量了cfDNA甲基化标记物与肿瘤标记物CA19-9通过血浆检测识别PDAC的准确性 ，如图3所示 ，在PDAC与正常比照组、CP的判别中 ，cfDNA甲基化标记物的准确性均要优于肿瘤标记物CA19-9（AUC：0.907 vs 0.887 ，0.882 vs 0.838） ，而cfDNA甲基化标记物与CA19-9团结应用可提高PDAC血浆检测的准确性 ，AUC划分为0.935和0.896。
图3 cfDNA甲基化标记物与肿瘤标记物CA19-9判别PDAC准确性的较量
在PDAC与正常比照组的测试集中 ，检测特异性为0.89时 ，cfDNA甲基化标记物在I期 PDAC中的迅速度要优于CA19-9。在PDAC与CP的测试集中 ，检测特异性为0.86时 ，cfDNA甲基化标记物的迅速度在PDAC各阶段中都要优于CA19-9。这说明 ，cfDNA甲基化标记物比肿瘤标记物CA19-9更相宜用于PDAC的早期检测。
总而言之 ，ca88基因使用RRBS要领在全基因组规模内筛选出了PDAC特异性DNA甲基化标记物 ，由此构建的PDAC靶向检测及其PDAC分类模子能使用血浆样本 ，将PDAC血浆从非恶性疾病中识别 ，显示了其应用于PDAC早期筛查和增进PDAC早期诊断的潜力。
资料泉源：
https://cslide.ctimeetingtech.com/esmo2020/attendee/confcal_2/presentation/list?q=Early+detection+of+pancreatic+ductal+adenocarcinoma+%28PDAC%29+using+methylation+signatures+in+circulating+tumour+DNA
关于ca88基因
ca88基因是由高远教授、张鹍教授、张江立、刘强及刘蕊博士五位来自科研学术、医药企业、金融投资行业的专家于2014年配合建设 ，致力于癌症疾病的早筛、早诊 ，为人类康健效劳是企业的焦点宗旨。
基于公司独创的专利甲基化基因检测手艺 ，公司开发了险些笼罩所有常见肿瘤的癌症早筛早诊手艺和产品 ，包括肺癌、结直肠癌、肝癌、胃癌、食道癌、胰腺癌、甲状腺癌等 ，并且经由大宗临床样本和康健行列验证 ，性能居于天下领先职位。
公司在美国（圣地亚哥）和中国（上海）均有设有研发中心 ，自力医学磨练机构 ，在中国的GMP工厂已经通过相关验收 ，现在正在同步举行FDA和NMPA申报。相关效劳在大样本验证的基础上已经推向市场。
